Massive parallele Sequenzierung

DNA-Sequenzierungsgeräte

Massive Parallel Sequencing oder Massively Parallel Sequencing ist einer von mehreren Hochdurchsatz-Ansätzen zur DNA-Sequenzierung, die das Konzept der massiv-parallelen Verarbeitung nutzen; es wird auch Next-Generation Sequencing (NGS) oder Second-Generation Sequencing genannt. Einige dieser Technologien wurden zwischen 1994 und 1998 entwickelt und sind seit 2005 kommerziell erhältlich. Diese Technologien nutzen miniaturisierte und parallelisierte Plattformen für die Sequenzierung von 1 Million bis 43 Milliarden kurzen Reads (jeweils 50 bis 400 Basen) pro Gerätelauf.

Viele NGS-Plattformen unterscheiden sich in ihren technischen Konfigurationen und ihrer Sequenzierungschemie. Ihnen gemeinsam ist das technische Paradigma der massiven parallelen Sequenzierung über räumlich getrennte, klonal amplifizierte DNA-Vorlagen oder einzelne DNA-Moleküle in einer Durchflusszelle. Dieses Konzept unterscheidet sich stark von der Sanger-Sequenzierung – auch bekannt als Kapillarsequenzierung oder Sequenzierung der ersten Generation -, die auf der elektrophoretischen Trennung von Kettenabbruchprodukten basiert, die in einzelnen Sequenzierungsreaktionen erzeugt werden. Mit dieser Methode kann die Sequenzierung in größerem Maßstab durchgeführt werden.

DNA-Sequenzierung ist die Bestimmung der Nukleotid-Abfolge in einem DNA-Molekül. Die DNA-Sequenzierung hat die biologischen Wissenschaften revolutioniert und die Ära der Genomik eingeleitet. Seit 1995 konnte durch DNA-Sequenzierung das Genom von über 50.000 (Stand: 2020) verschiedenen Organismen analysiert werden. Zusammen mit anderen DNA-analytischen Verfahren wird die DNA-Sequenzierung u. a. auch zur Untersuchung genetisch bedingter Erkrankungen herangezogen. Darüber hinaus ist die DNA-Sequenzierung als analytische Schlüsselmethode, insbesondere im Rahmen von DNA-Klonierungen (engl. molecular cloning), aus einem molekularbiologischen bzw. gentechnischen Laborbetrieb heute nicht mehr wegzudenken. …

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Synonyme
Massive Parallel Sequencing, Massively Parallel Sequencing, Next-Generation Sequencing, Second-Generation Sequencing, NGS, DNA-Sequenzierung, Next Generation Sequencing-Plattform,

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